1.治疗范围不同：伊曲康唑的治疗范围比较广在妇科、皮肤科或者真菌感染上都有应用，而氟康唑一般用于治疗念珠菌病、球孢子菌病等。2.服用方式不同：氟康唑，所以采用局部或者口服进行用药，伊曲康唑一般可以通过口服或者静滴的方式。 氟康唑和伊曲康唑都可以用于治疗真菌感染，在具体用药选择上，要根据个人体质以及具体病情在医生的建议和指导下进行用药，谨遵医嘱。