重组人干扰素α2а栓的副作用是少数病人在初次用药之后会出现轻微的腰腹部酸痛感，偶尔有患者在用药之后会出现一过性的低热或者是阴道不适以及外阴不适感，但一般不良反应会自行消失，不影响继续治疗。 该药物在使用的时候通常是小剂量的局部给药，一般不会出现药物过量的现象，如果患者不遵医嘱，用药之后出现了药物过量反应，要立即停药。