两个月宝宝大便不正常可能是以下几个原因引起的：1、可能是由于消化不良引起大便不正常。2、可能是甲状腺功能亢进引起大便次数出现异常。3、也可能是伤寒引起大便颜色异常。 如果是消化不良引起的可遵医嘱使用复方消化酶。如果是甲状腺功能亢进引起可在医生指导下使用复方碘溶液，伤寒引起可遵医嘱使用头孢曲松等治疗。