盐酸萘甲唑林滴鼻液可能会导致患者出现鼻腔有轻微的针刺感、烧灼感、鼻黏膜干燥，或者心率加快、头晕、头痛等副作用。长期使用本品还可能引起药物性鼻炎、反跳性鼻充血等不良反应。 对盐酸萘甲唑啉过敏的患者或者孕妇、儿童、甲状腺功能亢进患者、冠心病和高血压患者，需在医生指导下使用，盲目使用本品也容易出现不适。