盐酸莫西沙星氯化钠注射液属于哺乳期妇女，对喹诺酮类药物和莫西沙星过敏的人群、孕妇、18岁以下的患者的禁用药。 患有肝功能损伤的患者和因为肌腱疾病使用过喹诺酮类药物进行了相关治疗的患者，也需要禁用该药物。先天性的QT间期延长的患者，以及出现了电解质紊乱、心力衰竭伴有左心室射血分数降低的患者、曾经出现过心律失常的患者，也需要禁用本品。