蒿甲醚由于剂型不同、规格不同，用法用量也不同。蒿甲醚片需要口服，一日1次，连服5天或7天，成人一次口服80mg，或按体重1.6mg/kg，首次加倍，儿童患者的用量则需要按年龄递减。蒿甲醚胶囊可以口服，每日1次，每次80-100mg，连用7天，首剂加倍。蒿甲醚注射液需要肌内注射，成人首剂160mg，第2日起每日1次，每次80mg，连用5日。小儿患者也需肌内注射，首剂按体重3.2mg/kg；第2-5日，每次按体重1.6mg/kg，每日1次。不建议自行用药，建议到医院面诊后，遵医嘱使用，才能达到良好的治疗效果。